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Guida per un laboratorio digitale connesso su AWS
Panoramica
Questa guida ti aiuta a connettere strumenti di dati e file di sistema di laboratorio per le scienze della vita al cloud AWS, tramite Internet o una connessione diretta a bassa latenza. Puoi ridurre le spese di storage per i dati a cui si accede meno spesso o renderli accessibili per l'elaborazione ad alte prestazioni per genomica, imaging e altri carichi di lavoro intensi, tutto su AWS.
Come funziona
Questo diagramma di architettura ti aiuta a imparare come connettere strumenti per le scienze della vita e sistemi di laboratorio basati su file al cloud e fornire accesso ed elaborazione scalabili ai dati utilizzando Amazon Web Services (AWS).
Principi di Well-Architected
Il diagramma dell'architettura sopra riportato è un esempio di una soluzione creata tenendo conto delle best practice Well-Architected. Per essere completamente Well-Architected, dovresti seguire il maggior numero possibile di best practice.
Con l'emergere di nuove origini dati e nuovi partner, è possibile impiegare diversi servizi di trasferimento dati per adattarsi a questi cambiamenti nei modelli di accesso. Per gli ambienti multisito, S3 File Gateway può essere utilizzato per il trasferimento conservando una cache in loco per altre applicazioni. Transfer Family consente alle entità partner come le CRO di caricare facilmente i risultati degli studi.
Ai fini della protezione dei dati, ti consigliamo di proteggere le credenziali degli account AWS e di configurare account utente individuali con AWS Identity and Access Management (IAM), in modo che a ciascun utente vengano concesse solo le autorizzazioni necessarie per adempiere alle proprie mansioni lavorative. Inoltre, ti consigliamo l'uso della crittografia a riposo, mentre i servizi offrono per impostazione predefinita la crittografia in transito.
DataSync sfrutta uno o più endpoint VPC per garantire che se una zona di disponibilità non è disponibile, l'agente possa raggiungere un altro endpoint. DataSync è un servizio scalabile che sfrutta set di agenti per spostare i dati. Le attività e gli agenti possono essere dimensionati in base alla richiesta e alla quantità di dati da migrare.
DataSync registra tutti gli eventi su Amazon CloudWatch. Se un'attività non può essere completata, è possibile intraprendere operazioni per comprendere meglio il problema e dove si verifica l'errore. Una volta completate le attività, è possibile avviare processi post-elaborazione per completare la fase successiva della procedura della pipeline.
Amazon S3 fornisce un'infrastruttura di storage altamente durevole progettata per lo storage di dati mission-critical e primari.
Lo storage FSx for Lustre offre latenze inferiori al millisecondo, fino a centinaia di GB/s di throughput e milioni di IOPS.
Grazie all'utilizzo di tecnologie serverless che si dimensionano on demand, pagherai soltanto le risorse che utilizzi. Per ottimizzare ulteriormente i costi, è possibile arrestare gli ambienti notebook in SageMaker quando non sono in uso. Se non intendi utilizzare la dashboard di visualizzazione di Amazon QuickSight, puoi scegliere di non distribuirla per risparmiare sui costi.
I costi di trasferimento dati sono composti da due aree principali: DataSync, che viene addebitato in base a una tariffa di trasferimento per GB; e Direct Connect o VPN trasferiti. Inoltre, potrebbero essere addebitati costi aggiuntivi per le zone di disponibilità incrociata se vengono utilizzati endpoint VPC.
Le metriche di CloudWatch consentono agli utenti di prendere decisioni basate sui dati sulla base di avvisi e tendenze. Tramite un ampio utilizzo dei servizi gestiti e della scalabilità dinamica, potrai ridurre l'impatto ambientale dei servizi di back-end. La maggior parte dei componenti è autosufficiente.
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Avvertenza
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