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Guía para laboratorios digitales conectados en AWS
Información general
Esta guía le ayuda a conectar los instrumentos de datos de las ciencias biológicas y los archivos de sistemas de laboratorio a la nube de AWS, ya sea a través de Internet o de una conexión directa con baja latencia. Puede reducir los gastos de almacenamiento de los datos a los que se accede con menos frecuencia o hacerlos accesibles para la computación de alto rendimiento para la genómica, la obtención de imágenes y otras cargas de trabajo intensas, todo en AWS.
Funcionamiento
Este diagrama de arquitectura le ayuda a aprender a conectar instrumentos de ciencias biológicas y sistemas de laboratorio basados en archivos a la nube y a proporcionar acceso a datos y computación escalables mediante Amazon Web Services (AWS).
Pilares de AWS Well-Architected Framework
El diagrama de arquitectura mencionado es un ejemplo de una solución que se creó teniendo en cuenta las prácticas recomendadas de una buena arquitectura. Para tener completamente una buena arquitectura, debe seguir todas las prácticas recomendadas de buena arquitectura posibles.
A medida que surgen nuevos orígenes de datos y socios, se puede utilizar una variedad de servicios de transferencia de datos para adaptarse a los cambios de estos patrones de acceso. Para entornos de varios sitios, S3 File Gateway se puede usar para transferir mientras se conserva una memoria caché local para otras aplicaciones. Transfer Family permite a las entidades asociadas, como las CRO, cargar fácilmente los resultados de los estudios.
Con fines de protección de datos, le recomendamos que proteja las credenciales de las cuentas de AWS y configure cuentas de usuario individuales con AWS Identity and Access Management (IAM), de modo que cada usuario reciba solo los permisos necesarios para cumplir con sus obligaciones laborales. También le sugerimos que utilice el cifrado en reposo y que los servicios utilicen el cifrado en tránsito de forma predeterminada.
DataSync aprovecha uno o varios puntos finales de VPC para garantizar que, si una zona de disponibilidad no está disponible, el agente pueda llegar a otro punto final. DataSync es un servicio escalable que aprovecha los conjuntos de agentes para mover datos. Las tareas y los agentes se pueden escalar en función de la demanda de la cantidad de datos que se deben migrar.
DataSync registra todos los eventos en Amazon CloudWatch. Si un trabajo falla, se pueden tomar unas medidas determinadas para comprender mejor el problema y dónde falla la tarea. Una vez finalizadas las tareas, se pueden iniciar los trabajos de posprocesamiento para completar la siguiente fase del proceso de la canalización.
Amazon S3 proporciona una infraestructura de almacenamiento altamente duradera diseñada para el almacenamiento de datos primarios y de misión crítica.
El almacenamiento FSx for Lustre proporciona latencias de menos de milisegundos, hasta cientos de GB/s de rendimiento y millones de IOPS.
Mediante el uso de tecnologías sin servidor que escalan bajo demanda, solo paga por los recursos que utiliza. Para optimizar aún más los costos, puede detener los entornos de cuadernos en SageMaker cuando no estén en uso. Si no tiene intención de utilizar el panel de visualización de Amazon QuickSight, puede optar por no implementarlo para ahorrar costes.
Los cargos por transferencia de datos se dividen en dos áreas principales: DataSync, que se cobra según una tarifa por GB transferido, y Direct Connect o datos de VPN transferidos. Además, es posible que se apliquen cargos por uso entre zonas de disponibilidad si se utilizan puntos de conexión de VPC.
Las métricas de CloudWatch permiten a los usuarios tomar decisiones basadas en datos en función de alertas y tendencias. Al utilizar ampliamente los servicios administrados y el escalado dinámico, minimiza el impacto ambiental de los servicios de backend. La mayoría de los componentes son autosuficientes.
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El código de muestra; las bibliotecas de software; las herramientas de línea de comandos; las pruebas de concepto; las plantillas; o cualquier otra tecnología relacionada (incluida cualquiera de las anteriores que proporcione nuestro personal) se brinda como contenido de AWS bajo el Contrato de cliente de AWS, o el contrato escrito pertinente entre usted y AWS (lo que sea aplicable). No debe utilizar este contenido de AWS en sus cuentas de producción, ni en producción ni en otros datos críticos. Es responsable de probar, proteger y optimizar el contenido de AWS, como el código de muestra, según corresponda para el uso de grado de producción en función de sus prácticas y estándares de control de calidad específicos. La implementación de contenido de AWS puede incurrir en cargos de AWS por crear o utilizar recursos con cargo de AWS, como poner en marcha instancias de Amazon EC2 o utilizar el almacenamiento de Amazon S3.
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